Designing an antigen Covid-19 tests evaluation ontology and knowledge graph
| Thesis title: | Designing an antigen Covid-19 tests evaluation ontology and knowledge graph |
|---|---|
| Author: | Haniková, Kateřina |
| Thesis type: | Diploma thesis |
| Supervisor: | Svátek, Vojtěch |
| Opponents: | Křemen, Petr |
| Thesis language: | English |
| Abstract: | This master thesis focuses on creating an ontology from existing XML data about antigen Covid-19 tests. The data was gathered manually from different resources regarding the sensitivity and specificity of antigen Covid-19 tests. The XML file served only for the web presentation, and the data structure was adjusted for this purpose. Since no dataset of this kind was found, it was decided to create a knowledge graph to open the data to broader reuse. To do so, an ontology was designed to give the data proper semantics. The field of ontology engineering is constantly evolving, and many tools, methods and methodologies exist for developing ontologies. It depends on an ontological engineer and a domain of interest which methods and tools will be preferred. The ontology developed in this thesis is called the Antigen Covid-19 Tests Evaluation Ontology (ACTE) and was designed from competency questions. Also, this work includes a simple analysis of the data with SPARQL queries to inspire future development. In the end, the ontology designed in OWL was reengineered with PURO Modeler. |
| Keywords: | ontology; knowledge graph; competency questions; PURO Modeler; Covid-19; antigen tests |
| Thesis title: | Návrh ontologie a znalostního grafu pro antigenní Covid-19 testy |
|---|---|
| Author: | Haniková, Kateřina |
| Thesis type: | Diplomová práce |
| Supervisor: | Svátek, Vojtěch |
| Opponents: | Křemen, Petr |
| Thesis language: | English |
| Abstract: | Tato diplomová práce se zabývá návrhem ontologie z existujících XML dat o antigenních covid testech dostupných na českém trhu. Data byla manuálně sesbíraná z různých zdrojů, které se zabývají hodnocením senzitivity a specificity antigenních covid testů. XML soubor sloužil pouze pro to, aby data mohla být zobrazena na webu, tomuto cíli odpovídá i struktura dat. Protože je takový dataset unikátní a žádný podobný nebyl nalezen, bylo rozhodnuto vytvořit znalostní graf z těchto dat a umožnit, aby data byla využita i jinak než jen pro webovou prezentaci. První, pro vytvoření znalostního grafu, byla potřeba vytvořit jednoduchou ontologii, která by dodala datům sémantiku. Oblast znalostního inženýrství se neustále vyvíjí a v současnosti existuje spousta nástrojů, metod a metodologií pro návrh ontologií. Záleží na ontologickém inženýrovi a doméně, jaká metoda a nástroje budou požity při vývoji ontologie. Ontologie vyvinutá v této diplomové práci se jmenuje Antigen Covid-19 Tests Evaluation Ontology (ACTE) a byla navrhnuta pomocí kompetenčních otázek. V této práci byla provedena jednoduchá analýza dat pomocí SPARQL dotazů, pro inspiraci, jakým směrem by se mohl ubírat další vývoj znalostního grafu. Na konci byla také OWL ontologie modelována pomocí PURO Modeleru. |
| Keywords: | kompetenční otázky; antigenní testy; PURO Modeler; ontologie; znalostní graf; Covid-19 |
Information about study
| Study programme: | Znalostní a webové technologie |
|---|---|
| Type of study programme: | Magisterský studijní program |
| Assigned degree: | Ing. |
| Institutions assigning academic degree: | Vysoká škola ekonomická v Praze |
| Faculty: | Faculty of Informatics and Statistics |
| Department: | Department of Information and Knowledge Engineering |
Information on submission and defense
| Date of assignment: | 3. 11. 2022 |
|---|---|
| Date of submission: | 29. 4. 2023 |
| Date of defense: | 1. 6. 2023 |
| Identifier in the InSIS system: | https://insis.vse.cz/zp/82637/podrobnosti |